山羊不同组织来源EST片段的生物信息学分析

编号 zgly0000560188

文献类型 期刊论文

文献题名 山羊不同组织来源EST片段的生物信息学分析

作者 冯付军  李祥龙  王建涛  唐春娟  王海亮 

作者单位 河北农业大学动物科技学院 

母体文献 生物信息学 

年卷期 2008,6(1)

页码 14-17,27

年份 2008 

分类号 Q944.13 

关键词 山羊  表达序列标签(EST)  生物信息学 

文摘内容 利用生物信息学方法，对GeneBank中截至2006年9月收录的全部来源于山羊基因的共计637条表达序列标签(EST)进行了综合及分类分析。结果显示，在来源于绒山羊含毛囊皮肤的392条EST序列中有48条为编码角蛋白或角蛋白关联蛋白的基因；在乳腺来源的245条EST中则无此类基因，而是如免疫球蛋白基因、维生素转运蛋白基因、MHC等诸多种类基因，以免疫和酶类居多。两类不同组织来源的FST相应基因相似之处最显著的是编码核糖体蛋白的基因，其中含毛囊皮肤组织的EST中有15．1％，乳腺组织为21．6％，并且有两种不同组织来源的EST组成的26条基序(contigs)中，编码核糖体蛋白的有17条，高达65．4％。