番薯属甘薯与牵牛EST-SSR标记开发及通用性分析

编号 zgly0001496115

文献类型 期刊论文

文献题名 番薯属甘薯与牵牛EST-SSR标记开发及通用性分析

作者 兰孟焦  吴问胜  黄水金  潘皓 

作者单位 江西省农业科学院作物研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年12期

年份 2015 

分类号 Q943.2 

关键词 甘薯  牵牛  EST-SSR  通用性 

文摘内容 通过对番薯(Ipomoea)属的12 812条甘薯和28 422条牵牛EST唯一序列进行检索分析,在319条甘薯EST序列中发现了共328个EST-SSRs,平均每20.41 kb出现1个甘薯SSR;在936条牵牛EST序列中发现962个EST-SSRs,平均每17.87 kb出现1个SSR;在检索到的甘薯和牵牛EST-SSRs中,二核苷酸重复类型的SSR最多,分别占各自检索总数的44.51%和40.64%。利用SSR-ESTs分别设计了36对甘薯EST-SSR引物和92对牵牛EST-SSR引物,其中有28对甘薯引物在8个甘薯品种中有扩增产物,13对引物扩增产物具有多态性,多态性引物占所设计甘薯引物的36.1%;42对牵牛EST-SSR引物在甘薯基因组中可以扩增出清晰的条带,其中19对有表现较好的多态性,占设计的牵牛EST-SSR引物的20.7%。结果表明,牵牛EST-SSR标记在甘薯上具有通用性,可用于甘薯基因组多样性分析。