银白杨叶绿体基因组密码子用法分析(英文)

编号 zgly0001332762

文献类型 期刊论文

文献题名 银白杨叶绿体基因组密码子用法分析(英文)

作者 周猛  龙伟  李霞 

作者单位 哈尔滨医科大学  生物信息科学与技术学院  南京林业大学国家林业局和江苏省林木遗传和基因工程重点实验室 

母体文献 Journal of Forestry Research 

年卷期 2008年04期

年份 2008 

分类号 Q943.2 

关键词 密码子用法  叶绿体  GC含量  银白杨 

文摘内容 通过计算银白杨叶绿体基因组中各基因的ENc值、RSCU值、CAI值和GC3s的含量,分析银白杨叶绿体基因组密码子用法,并采用目前普遍使用的多变量统计分析方法(对应分析)和ENc.plot方法探讨了若干重要因子对银白杨叶绿体基因组密码子用法的效应。对应分析结果显示在影响最大的第一条向量轴上,基因的坐标位置与GC3s(r=349)极显著相关,而与该基因的表达水平(CAI)无显著相关性,但是在第二、三向量轴上基因的坐标位置与该基因的表达水平(CAI)呈极显著相关(r=-0.348和r=0.602,),说明碱基突变是影响密码子发挥作用的主要因素,而少数基因密码子用法受到翻译选择的作用;ENC-plot分析结果也证明了这一点。图2表2参34。