蓖麻RcNHX2基因克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001529018

文献类型 期刊论文

文献题名 蓖麻RcNHX2基因克隆与生物信息学分析

作者 冯紫洲  耿学军  李平  张继星  陈永胜  霍红雁  冀照君  穆莎茉莉  丛娇娇  李惠根 

作者单位 内蒙古民族大学农学院  内蒙古民族大学生命科学学院  内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年11期

年份 2016 

分类号 S565.6  Q943.2 

关键词 蓖麻  液泡膜型钠氢逆向转运蛋白  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 液泡膜型钠氢逆向转运蛋白（Tonoplast Na+/H+antiporters,NHX）在植物耐盐方面具有重要意义。本研究利用RACE方法克隆了蓖麻Rc NHX2基因的3’端和5’端片段。最后设计全长引物获得蓖麻Rc NHX2全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,蓖麻液泡膜型钠氢逆向转运蛋白基因的c DNA完整的开放阅读框序列为1 626 bp,推测其可编码541个氨基酸;含有典型的液泡膜型钠氢逆向转运蛋白典型的Na+/H+交换泵(50NES52)和氨氯吡嗪咪的结合位点(84LFFIYLLPPI93);存在12个跨膜结构域,属于跨膜蛋白;预测其定位于细胞质膜和液泡膜及内质网膜。