猕猴桃溃疡病菌biovar 3群体MLVA分型技术的建立与应用

编号 zgly0001677878

文献类型 期刊论文

文献题名 猕猴桃溃疡病菌biovar 3群体MLVA分型技术的建立与应用

作者 赵志博  杜淑凤  李月  杨文  樊荣  王勇  龙友华 

作者单位 贵州大学农学院 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2019年04期

年份 2019 

分类号 S436.634 

关键词 猕猴桃细菌性溃疡病  群体结构  基因组分型  MLVA  流行 

文摘内容 丁香假单胞菌猕猴桃致病变种生物型3(Pseudomonas syringae pv. actinidiae biovar 3,Psa3)是猕猴桃溃疡病菌的世界流行群体,但仅在中国存在复杂的遗传多样性。开发适于Psa3群体分型的MLVA(multilocus variable-number tandem-repeat analysis)技术是探索中国Psa3起源与流行学特性的基础。本研究对7个Psa3菌株进行了全基因组测序,结合已公布的86个全基因组数据,进行比较分析发现,中国Psa3至少存在7个亚群;在各亚群间存在多态性的24个串联重复序列中,其中10个可以通过琼脂糖凝胶电泳区分开且变异指数合适,据此建立了适于Psa3的M LVA技术。采用该技术对分别来自贵州和陕西的62和9个Psa3菌株进行群体分型,分型结果与全基因组分析高度一致,证明该MLVA体系分型准确。MLVA分型结果表明:贵州主产区修文县Psa3有3个MLVA群体,其中亚群4的组内分化明显,代表最早发生的群体;而亚群1和3的结构单一,且多在新果园发现,是新传入群体。总之,本研究建立了一套可用于Psa3群体分型的MLVA技术,将有助于解析中国各猕猴桃产区Psa3群体结构,以及探索中国Psa3的起源、传播和流行学特征。