PRRSV广西分离株GXYL-1403全基因克隆与序列分析

编号 zgly0001516796

文献类型 期刊论文

文献题名 PRRSV广西分离株GXYL-1403全基因克隆与序列分析

作者 林思远  洪绍锋  黄加滨  韦莹  陈樱  黄伟坚  韦祖樟 

作者单位 广西大学动物科学技术学院动物传染病研究室 

母体文献 动物医学进展 

年卷期 2016年02期

年份 2016 

分类号 S852.65 

关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒  克隆  序列分析  遗传进化分析 

文摘内容 对本实验室所分离的1株猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)毒株GXYL-1403进行全基因组克隆和序列分析。参考已发表的扩增全长PRRSV序列的13对特异性引物,用RT-PCR方法对病毒基因组进行分段扩增。将扩增得到的PCR片段克隆到pMD18-T载体上,获得的重组质粒经PCR鉴定后进行序列测定。通过软件对所扩增序列进行拼接,获得GXYL-1403的全长序列,并对GXYL-1403进行比较和遗传进化分析。结果表明GXYL1403株基因序列全长为15 018bp,与国内外多株PRRSV毒株进行同源性比较发现,与VR-2332的相似性为89.1%,与TJ、JXA1、HEB1、HUB1、HUB2、TP株同源性达到了97.9%~98.1%。另外,GXYL-1403分离株nsp2蛋白含有高致病性PRRSV特异的1+29个氨基酸的缺失。特别重要的是,在缺失29个氨基酸区域的上游,含有连续20个氨基酸缺失,在下游出现了连续74个氨基酸的缺失。遗传进化分析发现美洲型PRRSV主要分为3个亚群,GXYL-1403跟高致病性PRRSV毒株属于同一分支,证实了GXYL-1403株为美洲型PRRSV毒株。