柑橘CjGH3.4和CjGH3.7基因的生物信息学分析及表达分析

编号 zgly0000989865

文献类型 期刊论文

文献题名 柑橘CjGH3.4和CjGH3.7基因的生物信息学分析及表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 庞少萍  谢让金  马岩岩  钱春  何绍兰  易时来  吕强  郑永强  邓烈 

作者单位 西南大学园艺园林学院  西南大学/中国农业科学院柑桔研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015(12)

页码 2362-2372

年份 2015 

关键词 柑橘  植物激素  逆境  GH3  基因表达 

文摘内容 以资阳香橙(Citrus junos Sieb.ex Tanaka)为材料,基于柑橘全基因组对两个生长素酰胺合成酶基因GH3(Gretchen Hagen 3),即Cj GH3.4和Cj GH3.7进行生物信息学分析及表达分析。结果表明:Cj GH3.4的开放阅读框(ORF)长度为1 830 bp,编码609个氨基酸;Cj GH3.7的ORF为1 800 bp,编码599个氨基酸。基因结构分析显示Cj GH3.4含有两个内含子,Cj GH3.7含有3个内含子。通过比对发现,这两个基因编码的蛋白序列与拟南芥、水稻、大豆、杨树等具有的较高的同源性,相似度可达66%~81%。