斑点叉尾鮰趋化因子SCYA126基因及其可变剪接

编号 zgly0000503784

文献类型 期刊论文

文献题名 斑点叉尾鮰趋化因子SCYA126基因及其可变剪接

作者 鲍宝龙  李家乐  汪桂玲  刘占江 

作者单位 上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室  奥本大学水产养殖系 

母体文献 中国水产科学 

年卷期 2007,14(1)

页码 1-7

年份 2007 

分类号 Q959.499 

关键词 斑点叉尾鮰  趋化因子  SCYA126  RNA可变剪接 

文摘内容 通过探针杂交筛选斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)BAC基因组文库, 利用引物步移的方法对阳性克隆BAC047_K12进行序列测定, 得到2815bp的SCYA126基因组序列。序列分析表明, SCYA126基因由2个外显子和1个内含子组成; 外显子拼接的序列与SCYA126 cDNA序列完全一致, 编码92个氨基酸, 在N端含有2个相邻的半胱氨酸(CC)和2个不相邻的半胱氨酸, 为典型的CC趋化因子亚家族成员; 其上游调控序列包含TATA框启动子序列和一些与免疫相关的转录因子结合位点。另外, 根据与GenBank接收号为BM029630的EST序列的比较分析, 发现SCYA126基因组中的内含子没有被剪接, 导致翻译后可能产生N端部分缺失的SCYA126蛋白。在胰脏和肝脏中确认了高表达的包含内含子的mRNA的存在, 而且其表达量要明显高于正常剪接的SCYA126mRNA。