东北虎源犬瘟热病毒H基因生物信息学分析

编号 zgly0001576858

文献类型 期刊论文

文献题名 东北虎源犬瘟热病毒H基因生物信息学分析

作者 江峰  王昊宁  黄利亚  王晓龙 

作者单位 东北林业大学野生动物资源学院  东北林业大学保护医学与生态安全研究中心  长白山科学研究院 

母体文献 经济动物学报 

年卷期 2018年01期

年份 2018 

分类号 S852.65 

关键词 犬瘟热病毒  东北虎  H基因  基因型  位点变异 

文摘内容 从GenBank数据库下载犬瘟热病毒14种基因型H基因237株序列,与3株东北虎源犬瘟热病毒序列比对之后进行同源性和位点变异分析,最后构建系统发育树。研究发现:3株东北虎源犬瘟热病毒(KC579362、KC579363和KM386683)分别属于Arctic-like和Asia-1基因型,与其他基因型毒株的同源性为89.94%~100%之间,H基因序列1 632(G→A)、1 664(C→T)、1 729(G→A)和1 795(G→A)位点的突变可能是CDV跨宿主传播给东北虎的关键突变位点。Arctic-like和Asia-1型毒株对东北虎威胁最大,H基因变异位点可为研究东北虎源序列遗传变异特征提供分子生物学依据。