重伞灵芝线粒体基因组在灵芝种间鉴定中的应用

编号 zgly0001694094

文献类型 期刊论文

文献题名 重伞灵芝线粒体基因组在灵芝种间鉴定中的应用

作者 孟国良  曾培明  王紫璎  程冰  叶丽云  吴小平 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心  福建农林大学生命科学学院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S567.31 

关键词 重伞灵芝  线粒体基因组  特异性引物  快速鉴定 

文摘内容 线粒体是动力工厂,能够进行氧化代谢实现能量的转化,参与三羧酸循环形成ATP。随着分子生物学和生物信息学技术的发展,担子菌灵芝属中已有几种灵芝的线粒体基因组被相继报道,但尚未有对重伞灵芝线粒体基因组的报道。本研究通过对重伞灵芝YX线粒体基因组进行组装注释,比较分析了与其他灵芝属物种的差异,根据差异序列构建分子标记对重伞灵芝菌株快速鉴定。结果显示重伞灵芝线粒体基因组大小为67340bp的闭合环形结构,含有15个普通蛋白编码基因,28个tRNA基因,以及rRNA的大小亚基基因。共5个基因含有12个内含子,主要为IB型,部分为ID型,包含LAGLIDADG1superfamily、GIY-YIGCterm superfamily保守结构域。根据重伞灵芝线粒体cox2基因设计的特异性引物扩增结果显示:4株重伞灵芝的cox2基因片段均可准确扩增,且扩增不出其他灵芝物种的cox2基因片段。基于各灵芝菌株线粒体cox2基因序列构建系统进化树,可以将4株重伞灵芝归在同一分支上,并且同源性为98%,与ITS鉴定结果一致。可见,基于线粒体基因cox2特异性引物可以快速地对重伞灵芝进行鉴定,且只需通过观察扩增条带的有无,无需测序,省时省力。