辣椒Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

编号 zgly0001433920

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒Ty1-copia类逆转座子逆转录酶序列的克隆及分析

作者 刁卫平  王述彬  刘金兵  潘宝贵  戈伟 

作者单位 江苏省农业科学院蔬菜研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2012年01期

年份 2012 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  Ty1-copia逆转座子  逆转录酶 

文摘内容 以辣椒属5个栽培种叶片为试材,利用Ty1-copia类逆转座子逆转录酶的保守序列设计简并引物,PCR扩增后均获得了260bp左右的目的条带。对C.annuum的扩增产物进行纯化、克隆和测序,经Mega4和DNAstar软件分析后,获得25条逆转录酶序列,核苷酸序列长度变化范围为225～272bp,这些序列存在高度的异质性,主要表现为缺失突变,同源性范围为23.1%～93.2%,核苷酸聚类分为7个组。翻译成氨基酸后,有9条序列存在1～3个不同程度的终止密码子突变,4条序列存在移框突变。将这25条逆转录酶的氨基酸序列与已发表的不同物种同一类型逆转座子的逆转酶序列进行聚类分析,表明辣椒的Ty1-copia型逆转座子与烟草、矮牵牛、马铃薯有很近的关系。