三角帆蚌GPX基因cDNA全序列的克隆及其编码蛋白的结构分析

编号 zgly0000702904

文献类型 期刊论文

文献题名 三角帆蚌GPX基因cDNA全序列的克隆及其编码蛋白的结构分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李西雷  汪桂玲  李家乐  袁一鸣 

作者单位 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室  上海市高校水产养殖学E研究院 

母体文献 遗传 

年卷期 2010,32(4)

页码 360-368

年份 2010 

分类号 Q959.4 

关键词 三角帆蚌  GPX基因  RACE  编码蛋白 

文摘内容 根据本实验室构建的三角帆蚌cDNA文库中已标注的EST序列,利用cDNA末端快速扩增法(RACE)克隆了三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)基因cDNA全序列。序列分析表明,该基因cDNA序列全长1286bp,包括5′端非翻译区(Untranslated Region)39bp、3′端非翻译区659bp和开放阅读框(Open reading frame,ORF)588bp,共编码195个氨基酸,分子量约为22.2kDa,理论等电点为8.44,属于含硒类GPX。该氨基酸序列具有GPX所有亚型中均高度保守的3个环状结构,对酶的三级结构起稳定作用。在线分析结果表明: GPX的氨基酸序列不存在明显的疏水区,也不存在信号肽序列。氨基酸相似性对比结果显示,三角帆蚌GPX氨基酸序列与脊椎动物GPX-2及GPX-1的序列相似度较高,为73.1%-80.8%,与其他型GPX相似度较小,相似度低于60%。构建的系统进化树显示三角帆蚌GPX与其他几种鱼类GPX聚为一类,与其他已发表的几种软体动物GPX相距较远,推测本实验克隆的三角帆蚌GPX基因和已发表的软体动物不属于同一种GPX类型。