辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析

编号 zgly0001561269

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析

作者 张焕欣  董春娟  尚庆茂 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2017年12期

年份 2017 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  GRAS基因家族  进化分析  表达特性 

文摘内容 基于辣椒全基因组数据信息,利用生物信息学方法对CaGRAS基因家族进行了系统鉴定和进化分析,并通过Real-time PCR方法检测了CaGRAS家族组织表达模式和对PEG6000、盐胁迫的应答。结果表明:在辣椒中存在54个CaGRAS基因,除11号染色体外其余染色体均有分布,外显子数1~3,等电点4.97~9.13;系统进化分析显示CaGRAS基因可分为8个进化群;CaGRAS基因具有不同的表达模式,在根、茎、叶片和茎尖中优势表达的基因分别有34、8、3和8个;多数CaGRAS基因能响应PEG6000和盐胁迫,其中CaGRAS11、CaGRAS30、CaGRAS40、CaGRAS44和CaGRAS50受到PEG6000和盐胁迫的强烈诱导。本研究为深入解析CaGRAS家族基因的功能奠定了一定基础。