油茶基因组SMRT数据的统计分析

编号 zgly0001631753

文献类型 期刊论文

文献题名 油茶基因组SMRT数据的统计分析

作者 赵松子 

作者单位 江西省林业科学院 

母体文献 南方林业科学 

年卷期 2018年02期

年份 2018 

分类号 S794.4 

关键词 油茶  单分子实时测序  基因组  茶树 

文摘内容 利用PacBio SMRT技术对普通油茶(Camellia oleifera)良种赣无1号进行全基因组测序,获得40.1 G的酶读段数据,共计3 862 324条酶读段。亚读段的数据量为40.06 G,共计4 730 681条亚读段。对亚读段数据及茶树(C.sinensis)基因组进行比对分析,结果表明,测序正确率为91.41%,普通油茶与茶树基因组序列的相似度为93.38%。