基于生物信息学的胶孢炭疽菌效应分子的筛选

编号 zgly0001648402

文献类型 期刊论文

文献题名 基于生物信息学的胶孢炭疽菌效应分子的筛选

作者 赵美  郑文博  皮磊  周而勋  舒灿伟 

作者单位 华南农业大学农学院广东省微生物信号与作物病害防控重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年18期

年份 2018 

分类号 S432.44 

关键词 胶孢炭疽菌  效应蛋白  信号肽  致病机理  寄主互作 

文摘内容 隶属炭疽菌属的胶孢炭疽菌(C. gloeosporioides)是农业和林业生产上重要的病原真菌,可以引起两百多种植物产生病害,对农林业造成严重的经济损失。效应蛋白在胶孢炭疽菌侵染寄主植物的过程发挥了关键作用。为了能筛选出胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides)的效应蛋白,以便开展对该菌与寄主的互作研究。本研究利用已经发表的胶孢炭疽菌的基因组序列,根据效应蛋白的主要特征,利用一系列生物信息分析服务器(SignalP, TMHMM, Protcomp, big-PI Predictor, TargetP和Blast),对该菌的效应蛋白进行预测和分析。我们共分析了胶孢炭疽菌的15 381个蛋白质序列,最后获得了443个符合效应蛋白特征的候选效应子,其中有86个具有预测功能。本研究为阐明炭疽病与植物寄主之间的相互作用提供理论依据。