毛果杨1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸合酶(HDS)基因的生物信息学分析

编号 zgly0000789033

文献类型 期刊论文

文献题名 毛果杨1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸合酶(HDS)基因的生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 刘立辉  李成浩  杨静莉  夏德安 

作者单位 林木遗传育种国家重点实验室 

母体文献 农业科学与技术: 英文版 

年卷期 2012,13(1)

页码 1-3,28

年份 2012 

分类号 S 

关键词 HDS  毛果杨  生物信息学  萜类 

文摘内容 [目的]研究HDS基因问的同源性及其进化关系。【方法】以毛果杨的HDS基因为研究对象, 利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区以及二级结构和三级结构的预测与分析。并与其他10个物种的HDS基因序列进行多重比对与进化分析。[结果]毛果杨HDS基因的单链mRNA序列长1956bp, 编码由656个氨基酸组成的蛋白质, 该蛋白质相对分子质量为72937.03, 其中含量最高的是I一, 为10.50%; 整个多肽中疏水性氨基酸只占39.63%, 有10个亲水区和6个疏水区; 与其他10个物种同源性多重比对发现同源性最高达99%。[结论]毛果杨HDS基因处于稳定状态, 编码的蛋白为亲水性蛋白, 在进化过程中是保守的; 试验中获得的保守区段序列信息为新基因的克隆奠定了基础。