毛果杨基因组序列草图的构建与初步分析

编号 zgly0000821232

文献类型 期刊论文

文献题名 毛果杨基因组序列草图的构建与初步分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 田郎 

作者单位 中国热带农业科学院橡胶研究所 

母体文献 陕西林业科技 

年卷期 2013(2)

页码 100-108

年份 2013 

分类号 S718.45 

关键词 基因组序列草图  蛋白质结构域  基因组复制  拟南芥属  编码基因  染色体重排  特异性基因  序列测定 

文摘内容 本文报道黑三角叶杨(Populus trichocarpaTorr.＆Gray),也即毛果杨全基因组序列测定及分析结果。采用鸟枪测序法并结合遗传作图最终获得该物种全基因组序列草图。本研究还鉴定出45 000多个蛋白质编码基因。分析结果进一步显示,该物种在杨柳科属种分化之前曾经历过一次全基因组复制事件,大约有8 000对经复制产生的重复基因至今依然保留在杨属基因组之中;至于年代更为久远的另一次复制事件则发生在杨属与拟南芥属种系分化之前。与拟南芥属相比,杨属植物在核苷酸取代,串联基因重复,以及染色体重排上似乎均显得较为缓慢。杨属基因组的蛋白质编码基因明显多于拟南芥属,每一个拟南芥基因平均约存在1.4至1.6个杨属同系物。不过,该两个基因组中蛋白质结构域的相对频率基本相同。此外,在杨属基因组中还发现大量与木质素纤维素壁生物合成,分生组织发育,抗性,以及代谢物转运相关的特异性基因。