红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选

编号 zgly0001652555

文献类型 期刊论文

文献题名 红毛丹SSR-PCR反应体系优化及多态性标记筛选

作者 林兴娥  牛俊海  陈莹  马蔚红  臧小平  葛宇  王甲水  周兆禧 

作者单位 中国热带农业科学院海口实验站  中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所  海南大学热带农林学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年21期

年份 2018 

分类号 S667.9 

关键词 红毛丹  SSR  体系优化  引物筛选 

文摘内容 为建立适宜红毛丹SSR-PCR反应的最佳体系并筛选出具有多态性的SSR引物,采用L16（45）正交试验设计对反应体系中的各组分(模板DNA,引物, Mg2+, dNTPs和Taq DNA聚合酶)进行了优化,建立了红毛丹SSR-PCR的最佳反应体系（20μL）:DNA模板30 ng、dNTPs 0.40 mmol/L、引物0.4μmol/L、Taq DNA聚合酶1.5 U、Mg2+1.50 mmol/L;利用优化后的SSR-PCR体系和6份红毛丹种质基因组DNA模板,从50对SSR引物中筛选出11对条带清晰、多态性丰富、重复性好的SSR引物,多态比例达22%。本研究为后续红毛丹种质资源遗传多样性分析、分子指纹图谱构建和品种鉴定等研究提供了技术参考。