甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析

编号 zgly0001496100

文献类型 期刊论文

文献题名 甘薯果糖-1,6-二磷酸醛缩酶5基因(IbFBA5)的克隆与生物信息学分析

作者 苏在兴  李强  唐维  刘亚菊  后猛  闫会  王欣  张允刚  马代夫 

作者单位 中国农业科学院甘薯研究所  江苏徐州甘薯研究中心农业部甘薯生物学与遗传育种重点实验室江苏徐淮地区徐州农业科学研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年11期

年份 2015 

分类号 S531 

关键词 甘薯  果糖-1  6-二磷酸醛缩酶  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 本研究利用甘薯徐薯18和徐781转录组测序结果,筛选到一条与淀粉合成相关的差异表达Unigene,编号为T1-30656。以徐781为材料,克隆该片段,并对其进行重测序和生物信息学分析。结果表明,该片段为果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因的c DNA序列,该基因包含3个外显子和2个内含子,亚细胞定位在细胞质当中,将其命名为Ib FBA5。该c DNA长为1 341 bp,含1 074 bp的开放阅读框,编码357个氨基酸。其序列与番茄、油菜、粳稻和拟南芥等相似性在77%~79%之间。