青杄中sPPa1的cDNA序列克隆及其生物信息学分析

编号 zgly0001435390

文献类型 期刊论文

文献题名 青杄中sPPa1的cDNA序列克隆及其生物信息学分析

作者 曹一博  刘亚静  张凌云 

作者单位 北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室 

母体文献 植物科学学报 

年卷期 2012年04期

年份 2012 

分类号 Q943.2 

关键词 青杄  PPa1  克隆  RACE  生物信息学 

文摘内容 以青杄(Picea wilsonii)均一化cDNA文库为模板,通过RACE方法克隆得到青杄PPa1基因cDNA全长,对该cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、二级结构、三级结构及是否跨膜进行了分析预测;进行了多序列比对并构建了系统树,同时对PPa1在青杄各组织中的表达量进行了检测。结果表明:青杄PPa1基因共由216个氨基酸组成,分子量为24.55 kD,理论PI为5.83,属可溶性蛋白;二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲和β-折叠构成;PPa1在青杄花粉中表达量最高。研究为进一步研究青杄PPa1的功能奠定了基础。