pep_pattern.pl;搜索蛋白质序列模体的Perl脚本

编号 zgly0000855552

文献类型 期刊论文

文献题名 pep_pattern.pl;搜索蛋白质序列模体的Perl脚本

作者 李旭凯  彭良才  王令强 

作者单位 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室  华中农业大学生物质与生物能源中心  华中农业大学植物科学技术学院 

母体文献 华中农业大学学报 

年卷期 2014(4)

页码 1-6

年份 2014 

关键词 pep_pattern.pl  Perl脚本  蛋白质序列  模体  排列 

文摘内容 用Perl语言编写了一个pep_pattern.pl脚本,可从一组相关序列中搜索非常相似的序列片段,通过匹配所有可能的氨基酸片段的排列,统计每个匹配模体在序列中的出现频率和位置,搜索蛋白质序列中的2~4个多肽的模体。