萝卜扩展蛋白基因RsEXPB1克隆与表达特征分析

编号 zgly0001371333

文献类型 期刊论文

文献题名 萝卜扩展蛋白基因RsEXPB1克隆与表达特征分析

作者 荆赞革  柳李旺  龚义勤  姜立娜  孙新菊  周艳孔 

作者单位 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室  农业部南方蔬菜遗传改良重点开放实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2009年04期

年份 2009 

分类号 S631.1 

关键词 萝卜(Raphanus sativus L.)  扩展蛋白  基因克隆  表达特征 

文摘内容 本文根据GenBank中扩展蛋白序列设计特异引物,从萝卜高代自交系NAU-LVYH06中克隆到一个扩展蛋白基因RsEXPB1(GenBank accession No.GQ387363,GQ387364)。其编码区基因组序列长度为1430bp,包括4个外显子和3个内含子;RT-PCR获得长度为898bp的cDNA,开放读码框(ORF)为29～820bp,推导编码263个氨基酸,含有1个组氨酸(His-Phe-Asp,HFD)功能域,ORF和推导蛋白序列与拟南芥AtEXPB3(GenBank accession No.NM118965)同源性分别为87%、92%。半定量RT-PCR检测到该基因主要在萝卜生育前期的幼叶、肉质根木质部和韧皮部中表达,且表达丰度可能与该部位细胞生长分裂状态相关,差异较明显。