枸杞自交不亲和基因S-RNase密码子偏性分析

编号 zgly0001697135

文献类型 期刊论文

文献题名 枸杞自交不亲和基因S-RNase密码子偏性分析

作者 段淋渊  戴国礼  焦恩宁  秦垦 

作者单位 宁夏农林科学院枸杞工程技术研究所 

母体文献 西南林业大学学报(自然科学 

年卷期 2020年02期

年份 2020 

分类号 S567.19 

关键词 枸杞  密码子  偏好性  S-RNase  聚类分析 

文摘内容 为了掌握枸杞S-RNase密码子及其使用偏好性,利用EMBOSS和Codon W软件分析了枸杞S-RNase基因密码子的使用偏好性,并将其与酵母、大肠杆菌和柑橘等10种植物S-RNase基因密码子偏好性进行比对,结果表明:枸杞S-RNase密码子偏好以A/T结尾;RSCU值显示该基因高频率使用的密码子有9个,相较其他物种同源基因存在明显的密码子偏好性差异。此外,较密码子使用偏好性分析结果,基于S-RNase基因编码序列的聚类结果更能准确地反应物种之间的亲疏关系。比对其他物种该基因密码子的使用频率发现,同科物种差异较小,不同科物种差异较大;同时对比使用频率发现,枸杞S-RNase基因更适合导入酵母菌进行异源表达,但需要对其进行适当优化改造。