基于NGS技术的仔猪腹泻病毒检测

编号 zgly0001641774

文献类型 期刊论文

文献题名 基于NGS技术的仔猪腹泻病毒检测

作者 罗文涛  何启盖  陈芳洲  李静  周杰珑 

作者单位 西南林业大学生命科学学院  华中农业大学农业微生物学国家重点实验室  华中农业大学动物医学院 

母体文献 西南林业大学学报(自然科学 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S858.28 

关键词 NGS  猪  腹泻  病毒  PEDV  PCV3 

文摘内容 为探究四川某猪场反复暴发仔猪腹泻的原因,利用下一代测序技术(NGS)对该猪场的仔猪肠道样品进行检测,结合常规PCR、测序方法进行验证分析。结果表明:该猪场存在猪流行性腹泻病毒PEDV,通过对该场PEDV S1基因的进化树分析,发现该PEDV毒株属于独立的一个分支;同时还在该场病料中检测到猪圆环病毒3型(PCV3),该猪场腹泻问题可能是由于新型PEDV毒株和PCV3毒株混合感染导致。