利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱

编号 zgly0000341040

文献类型 期刊论文

文献题名 利用杉木的F1代群体构建遗传连锁图谱

作者 童春发  施季森 

作者单位 南京林业大学林木遗传和基因工程实验室 

母体文献 遗传学报 

年卷期 2004,31(10)

页码 1149-1156

年份 2004 

分类号 S722 

关键词 杉木  遗传连锁图谱  F1代群体  连锁相  隐马尔可夫链模型 

文摘内容 对于杉木1: 1分离的分子标记位点, 提出了一种新的构建遗传连锁图谱的策略。通过二点连锁分析, 任意两个位点的连锁相和重组率可以得到推断和估计。对于一个连锁群中的最优排序, 采用隐马尔可夫链模型的方法进行多位点的连锁分析。该作图方法比通常林木上所用的“拟测交”作图方法更有效。采用该作图策略, 利用句容0号无性系(♀)×柔叶杉(♂)的F1代群体的AFLP分子标记数据重建了句容0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱。在句容0号无性系的连锁图谱中, 有101个标记分布在11个连锁群上, 图谱的总长度为2282.6cM, 平均图距为22.6cM, 单个连锁群上最多含有17个标记, 最少含有5个标记; 在柔叶杉的连锁图谱中, 有94个标记分布在11个连锁群上, 图谱的总长度为2565.8cM, 平均图距为27.3cM, 单个连锁群上最多含有16个标记, 最少含有4个标记。构建的句容0号无性系和柔叶杉的遗传连锁图谱比原有的图谱分别增加了26个标记和28个标记, 双亲的图谱共增加了54个AFLP标记, 使图谱上的分子标记总数达到195个, 双亲遗传图谱的跨度均超过了2000cM, 基本上达到了杉木基因组的长度, 图谱的覆盖率接近于100%。利用新的作图方法可以较大提高分子标记在图谱上的分辨率, 得到可认为是覆盖了整个基因组的遗传连锁框架图。