家蚕传染性软化病病毒(桐乡株)5′端非编码区基因的克隆及序列分析

编号 zgly0001361073

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕传染性软化病病毒(桐乡株)5′端非编码区基因的克隆及序列分析

作者 李明乾  苘娜娜  蔡顺风  陈孝学  金伟  鲁兴萌 

作者单位 浙江大学动物科学学院无脊椎动物病理学研究室 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2009年01期

年份 2009 

分类号 S884.53 

关键词 家蚕  传软性软化病毒  5′端非编码区  序列分析 

文摘内容 为了探讨家蚕传染性软化病病毒的复制与翻译机制,利用cDNA 5′末端快速扩增(5′-RACE)技术获得了家蚕传染性软化病病毒桐乡分离株(Bombyxmoriinfectious flacherie virus,BmIFV-2)的5′端非编码区(non-coding region,NCR)。序列比较分析发现:BmIFV-2的5′-NCR由155个核苷酸组成,A+U含量达60.64%,其中包含1个起始密码子AUG;与坂城分离株(BmIFV-1)的5′-NCR相比,BmIFV-2的5′-NCR在5′末端缺少1个核苷酸,但核苷酸识别率为100%(即单核苷酸变异率为0),而且这个缺少的核苷酸并不影响其5′-NCR的二级结构。与已经证实具有内部核糖体进入位点(internal ribosome entry site,IRES)活性的Iflavirus属的2种病毒EoPV(Ectropis obliquapicor-na-like virus)和VDV-1(Varroa destructorvirus 1)的5′-NCR相比,BmIFV的5′-NCR可能也具有IRES活性。