两种微孢子虫全基因组中密码子偏好性比较

编号 zgly0001399944

文献类型 期刊论文

文献题名 两种微孢子虫全基因组中密码子偏好性比较

作者 张瑞芝  向恒  潘国庆  李田  周泽扬 

作者单位 西南大学蚕学与系统生物学研究所  西南大学生物技术中心  西南大学动物科技学院 

母体文献 蚕学通讯 

年卷期 2011年01期

年份 2011 

分类号 S884 

关键词 微孢子虫  密码子偏好性  比较基因组学 

文摘内容 微孢子虫(Microsporidia)是一类细胞内营专性寄生的单细胞真核生物。基于其已测得的两个典型种的基因组数据,比较了家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)与兔脑炎微孢子虫(Encephalitozoon cuniculi)之间全基因组的密码子偏好性异同。结果表明两基因组的密码子偏好性都较弱,基因表达程度都较低。而且二者之间确实存在显著差异,表现在兔脑炎微孢子虫的偏好性比家蚕微孢子虫的更弱,其最优密码子的偏好性也更弱,完全不同于家蚕微孢子虫偏向于使用第三位是A/U的最优密码子。这些差异与它们在核苷酸组成上的不同是一致的,有可能是两微孢子虫寄生于不同环境中导致了它们在密码子偏好性上的差异。