两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

编号 zgly0001445525

文献类型 期刊论文

文献题名 两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

作者 杨润婷  吴波  李翀  曾培  曾继吾  钟云  姜波  周碧容  钟广炎 

作者单位 西南大学园艺园林学院  广东省农业科学院果树研究所  农业部热带南亚热带果树生物学与遗传资源利用重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年06期

年份 2013 

分类号 S666.3 

关键词 柚  单核苷酸多态性  等位基因特异性 PCR  高分辨率熔解曲线分析  基因分型 

文摘内容 用两种常用的 SNP 分型方法,等位基因特异性 PCR 法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对 16 个柚栽培品种和 8 个柚杂种后代材料进行了 7 个 SNP 位点的分型研究。结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将 24 个样本分成了 22 种基因型。值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异。‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系。可见,AS-PCR 和 HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定。AS-PCR 法是一种准确、低成本的 SNP 分型方法,适合普通实验室使用,惟对 PCR 反应体系要求严格。HRMA 分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高。