藏红花柱头小RNA高通量测序及生物信息学分析

编号 zgly0001634813

文献类型 期刊论文

文献题名 藏红花柱头小RNA高通量测序及生物信息学分析

作者 卢晓慧  朱志明  岳俊阳 

作者单位 嘉兴职业技术学院信息技术分院  安徽农业大学园艺学院  嘉兴天禾藏红花专业合作社  合肥工业大学食品科学与工程学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 S567.239 

关键词 藏红花  小RNA  miRNA  高通量测序  生物信息学 

文摘内容 通过构建藏红花开花前2 d与开花日两个不同时期柱头的小RNA文库并进行高通量测序,分别获得3 711 809和2 303 043条序列。借助生物信息学的方法,共鉴定出164条保守的mi RNA。其中,随开花过程下调表达和上调表达的mi RNA分别是71和46条。靶基因预测及功能富集分析显示它们可能参与了硫辛酸生物合成、细胞程序性凋亡、花粉细胞的分化、脱落酸介导的信号途径等生物过程。本文筛选的藏红花成熟过程中的mi RNA为今后脱辅基类胡萝卜素代谢调控网络的研究提供了可能的线索。