鹰嘴豆WOX转录因子基因家族全基因组分析

编号 zgly0001634547

文献类型 期刊论文

文献题名 鹰嘴豆WOX转录因子基因家族全基因组分析

作者 张洪涛 

作者单位 哈尔滨师范大学生命科学与技术学院  黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年10期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S529 

关键词 鹰嘴豆  WOX基因家族  生物信息学 

文摘内容 WOX基因家族是植物中特有的转录因子家族,研究发现该基因家族调控植物生长发育的各个重要环节,本研究将在鹰嘴豆数据库中下载的WOX蛋白序列,利用HUMMER、Smart等软件进行筛选,鉴定出17个WOX基因家族成员,利用信息学方法对这些家族成员的基本信息,包括分子量、蛋白长度、等电点等进行分析,并利用生物信息学软件对鹰嘴豆WOX基因家族进化关系、保守区域、基因结构等进行系统性分析,将鹰嘴豆WOX基因家族分为古代进化支、中间进化支和现代进化支,结构分析表明该家族的全基因组序列是高度保守的,在进化过程中呈多样性。利用荧光PCR技术分析在盐胁迫下,根中WOX基因家族成员在不同时间点的表达情况,发现CarWOX5、CarWOX7和CarWOX11与耐盐胁迫调控密切相关。本研究对鹰嘴豆WOX基因家族进行了全面、系统的生物信息学分析,以期为后续的功能验证研究奠定基础。