油茶SOD基因片段克隆及序列分析

编号 zgly0000778728

文献类型 期刊论文

文献题名 油茶SOD基因片段克隆及序列分析

学科分类 220.45;经济林学

作者 郭春兰  张露 

作者单位 江西农业大学园林与艺术学院 

母体文献 草业科学 

年卷期 2012,29(3)

页码 417-421

年份 2012 

分类号 S794.9 Q943.2 

关键词 油茶  SOD  基因克隆  序列分析 

文摘内容 根据已报道的多种植物Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因的氨基酸序列的保守区域分别设计简并引物,以油茶(Camellia oleifera)叶片总RNA为模板,通过RT-PCR分别扩增得到一个375bp的Cu/Zn-SOD基因片段和一个429bp的Mn/Fe-SOD基因片段。将片段序列在NCBI网站上进行同源性比对,表明本研究克隆的结果均与多种植物的Cu/Zn-SOD和Mn/Fe-SOD基因存在亲缘关系,因而认为所克隆的基因片段就是油茶SOD基因;并运用DNAStar5.0软件分别进行序列分析,推导的氨基酸序列分别为125个残基和143个残基;具有所有植物SOD基因共有的保守区域;与多种植物Cu/Zn-SOD基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性均分别在80%和84%以上,与其他植物的Mn/Fe-SOD基因的核苷酸和氨基酸序列的同源性都在84%和86%以上。