柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析

编号 zgly0001693208

文献类型 期刊论文

文献题名 柑橘属SAUR基因家族的全基因组鉴定及表达分析

作者 王福生  余洪  胡洲  管德龙  张盼  朱世平  赵晓春 

作者单位 西南大学/中国农业科学院柑桔研究所  国家柑桔工程技术研究中心  陕西师范大学生命科学学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S666 

关键词 柑橘属  SAUR基因家族  基因表达  全基因组鉴定 

文摘内容 分析SAUR(Small auxin up-regulated RNA)基因家族在不同柑橘基因组中的数量、连锁群分布、基因结构、系统进化、基因表达模式等,从香橼、柚、莽山野橘和克里曼丁橘等基因组中分别鉴定到69、62、58和70个SAUR基因。SAUR在基因组上分布不均,呈现明显的串联重复现象,基因家族成员的差异可能是由于串联重复和染色体大片段复制引起。大多数柑橘SAUR基因不含内含子,含有SAUR特有的4个保守motif。系统进化树分析显示,来源于拟南芥、水稻、番茄、马铃薯和柑橘的629个SAUR基因分为9组,每一组都含有5个物种的家族成员,并且同一个物种的SAUR基因具有较近的遗传距离。顺式元件分析表明,CclSAUR基因家族成员的上游序列含有光响应、转录因子结合、激素响应、伤害响应、低温响应、玉米素代谢和类黄酮生物合成相关的元件。q RT-PCR分析结果显示,大多数CclSAUR都能响应外源IAA和低温处理。