应用T载体连接PCR技术分离黄嘴白鹭微卫星位点

编号 zgly0000792791

文献类型 期刊论文

文献题名 应用T载体连接PCR技术分离黄嘴白鹭微卫星位点

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 黄勋和  周晓平  方文珍  陈小麟 

作者单位 厦门大学生命科学学院  滨海湿地生态系统教育部重点实验室 

母体文献 厦门大学学报: 自然科学版 

年卷期 2012,51(2)

页码 280-285

年份 2012 

分类号 Q953 Q959.7 

关键词 微卫星分离  T载体连接PCR  黄嘴白鹭 

文摘内容 传统的微卫星分离策略对于低丰度的物种如鸟类而言,通常是低效的.探讨了一种改良的T载体PCR序列获取法用于黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)微卫星DNA的分离,称为T载体连接PCR(T-vector-ligation PCR,TVL-PCR).在获取第一侧微卫星序列的71个阳性克隆中,59个克隆含有重复序列,设计了48对位点特异巢式引物.经过两轮TVL-PCR后,31个位点的扩增产物为预期大小,经测序后获得21个完整的微卫星位点.除去侧翼序列过短和小卫星位点外,设计16个微卫星位点进行多态信息检测,其中7个位点显示出多态性,平均等位基因数为2～20,观察杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.375～0.958和0.477～0.956,所有位点都符合哈迪-温伯格平衡(HWE)和连锁平衡.说明TVL-PCR技术对低丰度微卫星物种的位点分离具有一定的应用价值.