枣Trihelix转录因子家族生物信息学分析

编号 zgly0001652473

文献类型 期刊论文

文献题名 枣Trihelix转录因子家族生物信息学分析

作者 姬俏华  薛宝平  张新草  张昊  党峰峰  林金辉  何伟红  王延峰 

作者单位 延安大学生命科学学院  福建农林大学作物科学学院  延安大学延陕西省延安红枣重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年21期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S665.1 

关键词 Trihelix  枣  转录因子  生物信息学 

文摘内容 Trihelix转录因子家族是一个在调节植物生长发育过程中起重要作用的小家族。但目前关于枣Trihelix转录因子家族成员的报道还很少。为了明确枣Trihelix家族成员的基本特征也为进一步研究其基因功能。本研究利用生物信息学方法从枣全基因组数据库中鉴定出29个Trihelix成员,并对其进行染色体定位、系统进化树、保守基序和基因结构分析。研究结果表明Trihelix家族成员不均匀地分布在12条染色体上;该家族分为5个亚家族,分别为GT-1、GT-2、GTγ、SIP1和SH4;家族成员高度保守,每个家族均具有其特殊的结构域;同一亚家族的基因结构基本相似。本研究初步明确了枣Trihelix转录因子家族成员的基本结构和功能,为进一步揭示其生物学功能提供理论依据。