蓼科大黄属植物CHS基因密码子偏爱性分析

编号 zgly0001566387

文献类型 期刊论文

文献题名 蓼科大黄属植物CHS基因密码子偏爱性分析

作者 马盛超  余鑫梅  姚慧鹏 

作者单位 四川农业大学生命科学学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 Q943.2 

关键词 大黄属CHS基因  密码子偏爱性  GC12  GC3  ENC  最优密码子 

文摘内容 为探究蓼科大黄属物种CHS基因密码子的偏爱性,鉴定出该类基因的最优密码子。利用EMBOSS、Codon W1.4.4和SPSS 17.0软件对24条来源于大黄属不同物种的CHS基因进行多元统计分析,以深入研究其偏爱性。结果表明,大黄属CHS基因密码子的GC3含量最高,其与GC12的相关性检验未达到显著水平。ENC-plot分析显示,24条CHS基因的ENC值均低于预期值。以上证明了自然选择是CHS基因密码子偏爱性形成的主导因素。筛选出的26个最优密码子中,17个密码子的第3位碱基为G/C,表明CHS基因最优密码子偏爱以G/C结尾。