基于SSR和ISSR的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析

编号 zgly0001496006

文献类型 期刊论文

文献题名 基于SSR和ISSR的鄱阳湖流域野生菰资源的遗传多样性分析

作者 王惠梅  吴国林  江绍琳  黄奇娜  奉保华  黄长干  江绍玫  吴建利 

作者单位 中国水稻研究所  江西财经大学  江西农业大学 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2015年01期

年份 2015 

分类号 Q943 

关键词 菰  居群  遗传多样性  SSR标记  ISSR标记 

文摘内容 用SSR和ISSR标记对鄱阳湖流域30个野生菰居群的遗传多样性与遗传结构进行了分析。筛选出的19对SSR引物共扩增出多态性条带253条,平均多态性条带比率(PPB)为91.67%,Nei’s基因多样性指数(He)和平均Shannon信息指数(I)分别为0.2712和0.4144,遗传相似性系数(GS)为0.5590~0.8368,遗传距离(GD)的变化范围为0.1632~0.4410;筛选出的14个ISSR标记引物共扩增出83条条带,平均多态性条带比率(PPB)为78.29%,Nei’s基因多样性指数(He)和平均Shannon信息指数(I)分别为0.2386和0.4174,遗传相似性系数(GS)为0.5132~0.9342,遗传距离(GD)变化范围为0.0658~0.4868。根据SSR和ISSR基因型数据,采用UPGMA法分别在阈值为0.698和0.728时可将30个野生菰居群聚为3类。可能受人为、水流、动物活动、风等多种因素的影响,居群间的亲缘关系与地理分布无明显相关性。本研究表明,鄱阳湖流域野生菰居群间SSR和ISSR基因型的多样性丰富,居群间的这种遗传差异或变异,对该地区乃至更大范围内野生菰的遗传进化、基因资源的开发利用和种质资源的保护有着重要意义。