中华鳖HMG1基因的克隆与序列分析

编号 zgly0000409323

文献类型 期刊论文

文献题名 中华鳖HMG1基因的克隆与序列分析

作者 郑济芳  胡弼  吴端生 

作者单位 南华大学生命科学与技术学院  南华大学医学院 

母体文献 水生生物学报 

年卷期 2006,30(2)

页码 192-197

年份 2006 

分类号 Q953 

关键词 高速泳动蛋白  克隆  进化  爬行动物 

文摘内容 为了解中华鳖(Pelodlscus sinensis)HMG1(High mobility group 1)的基因结构, 利用RT-PCR, 从中华鳖肝脏组织的总RNA中, 克隆并测序了中华鳖HMG1cDNA片段, 结果表明, 中华鳖HMG1基因的开放读码框(Open reading frame, ORF)长度为606bp, 编码202个氨基酸。中华鳖HMG1多肽链主要包含三个保守的区域: 位于多肽链N端的HMG盒区1(第9—80个氨基酸之间); 位于多肽链中心的HMG盒区2(第89-162个氨基酸之间); 位于多肽链C端的富含酸性氨基酸区域(第163—202个氨基酸之间)。在2个HMG盒区范围内, 中华鳖HMG1多肽链与红原鸡、人、虹鳟等物种的HMG1多肽链相比, 氨基酸同源性依次为96.5%、74%和67%。排序比较显示, 不同物种HMG1多肽链之间的富含酸性氨基酸区域的长度是不同的, 暗示了HMG1多肽链富含酸性氨基酸区域的长度可能受到选择压力的影响, 但这种选择压力没有使谷氨酸和天冬氨酸这两种酸性氨基酸之间区分开来。系统发生分析表明, 脊椎动物HMGl基因的HMG盒区1和盒区2分别形成了2个亚族。本研究首次报道爬行动物的HMG1基因。