棉铃虫中肠cDNA文库的构建及EST分析

编号 zgly0001410091

文献类型 期刊论文

文献题名 棉铃虫中肠cDNA文库的构建及EST分析

作者 邹朗云  曹广春  张谦  张彦  梁革梅  吴孔明  郭予元 

作者单位 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室 

母体文献 昆虫学报 

年卷期 2011年07期

年份 2011 

分类号 S435.622.3 

关键词 棉铃虫  中肠  cDNA文库  表达序列标签(EST)  序列分析 

文摘内容 中肠是苏云金芽孢杆菌Bacillus thuringiensis(Bt)发挥作用的主要部位,中肠上很多蛋白被认为是Bt毒素的结合蛋白。为了探索棉铃虫Helicoverpa armigera对Bt的抗性机制,我们运用RNA转录过程中的5’末端转换机制(Switching Mechanism at5’end of the RNA Transcript,SMART)技术构建了棉铃虫中肠的cDNA文库。先提取棉铃虫5龄幼虫中肠组织的总RNA,合成双链cDNA,经过均一化处理后,酶切、连接载体、转化到大肠杆菌Escherichia coli感受态细胞,最后进行滴度测试、文库扩增并进行EST序列测定。对该文库质量分析表明:文库滴度为2×106pfu/mL,重组率为100%,平均插入片段大于1kb,全长率为50%。最终成功得到1098条表达序列标签(expressed sequence tags,ESTs)序列,经Phrap程序聚类拼接后得到789条单基因簇(unigene),包括132个重叠群(congtigs)和657个单拷贝(singlets)。将聚类拼接后的789条ESTs序列在NT,NR和SWISSPORT库中进行本地化搜索,比对后发现:218条序列(27.62%)没有注解;119条序列(15.08%)注解不明确;452条序列(57.29%)有功能注解,并表达300多种基因产物。构建的文库各项指标均达到要求,该文库的构建为棉铃虫中肠各类基因的克隆及功能分析奠定了基础。