在PCR—DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应

编号 zgly0000314568

文献类型 期刊论文

文献题名 在PCR—DGGE研究土壤微生物多样性中应用GC发卡结构的效应

作者 罗海峰  齐鸿雁  薛凯  王晓谊  王川  张洪勋 

作者单位 中国科学院生态环境研究中心环境生物技术研究室 

母体文献 生态学报 

年卷期 2003,23(10)

页码 2170-2175

年份 2003 

分类号 Q938  S154.3 

关键词 PCR—DGGE  微生物多样性  GC发卡结构 

文摘内容 应用普通细胞裂解法提取3株实验菌株(Escherichia coli DH5a.aureus SA-1和Agrobacterium tumerfaciens 13129)的基因组DNA和应用基于高盐和长时高热的细胞裂解法提取7种不同土壤样品中的微生物的基因组DNA, 两组不同结构的引物F357GC, R518(在正向引物的5’端有GC发卡结构)和F357·R518分别对实验菌株和土壤样品中微生物的16SrRNA基因V3区进行扩增, 均得到了目的片段。比较了不同引物扩增的16SrDNA片段在DGGE中的不同电泳行为, 结果表明, 含GC发卡结构的PCR扩增产物在DGGE中能够得到很好的分离, 而无GC发卡结构的PCR产物则不能在DGGE中获得满意分离。引入GC发卡结构, 使得对不同微生物的定性和分类更深入细致。