硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析

编号 zgly0001436237

文献类型 期刊论文

文献题名 硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析

作者 梁楠松  曾凡锁  李博  郭梁  詹亚光 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2013年10期

年份 2013 

分类号 S792.153 

关键词 白桦  Tyl-copia类逆转座子  逆转录酶  转录活性  系统进化  异质性  简并杂交寡核苷酸引物 

文摘内容 利用Tyl-copia类逆转座子逆转录酶(RT)的保守区域设计引物,优化了扩增条件后利用RT-PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这21条逆转录酶序列(命名Bprt1-21)变化范围为205~290 bp,一致性为71.93%,异质性为1.1%~50.9%,翻译成氨基酸的异质性为0~57.1%。经SNP和MeJA处理的样品中,获得的逆转录酶序列基本是分别聚类,初步证明不同的Ty1-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19条逆转录转座子序列(DQ410748~DQ410766)进化关系发现,逆转录酶基本各自聚类,但是Bprt9、Bprt11和DQ410750进化关系比较接近,Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类,证明逆转座子存在水平传递。