编号
zgly0001479314
文献类型
期刊论文
文献题名
SSR在黑木耳和毛木耳转录组中的分布和序列特征
作者单位
华中农业大学应用真菌研究所
母体文献
菌物学报
年卷期
2014年02期
年份
2014
分类号
S646.6
关键词
黑木耳
毛木耳
转录组
简单重复序列
基序
文摘内容
以黑木耳和毛木耳转录组测序获得的转录本序列为基础,采用软件SSR Locator对两个物种中SSR的数量、分布和结构特征等方面进行分析,发现毛木耳中SSR的丰度和密度较黑木耳小。在两者的SSR中,三碱基和六碱基重复的出现最多。对含量最多的三碱基重复序列的基序进行分析表明富含GC的SSR在这两个种的转录组中占优势地位。