云南当前种植地方稻种SSR遗传多样性分析

编号 zgly0001410358

文献类型 期刊论文

文献题名 云南当前种植地方稻种SSR遗传多样性分析

作者 张恩来  徐福荣  汤翠凤  阿新祥  杨雅云  董超  张斐斐  徐安虎  戴陆园 

作者单位 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2011年06期

年份 2011 

分类号 S511 

关键词 SSR  遗传多样性  地方稻种  当前种植  云南 

文摘内容 选用20对SSR引物对2007-2008年间从云南省56个县(区)收集的416份地方稻种进行遗传多样性分析。共检测到116个等位变异,每个位点变幅为3～13,平均为5.8个;SSR引物多态性信息含量PIC指数平均为0.681,最小为RM18的0.349,最大的RM6748为0.891;56个县的PIC变幅为0.025～0.679,平均为0.381,勐海县的PIC最高,广南县等仅有1份参试材料的8个县的PIC最低。聚类结果表明,在遗传一致度为0.362处将56个县的稻种分为3个类群,第Ⅰ类包括勐海等54个县,在阈值为0.499处又分为2个亚类,其中亚类Ⅰ-1包括36个县,亚类Ⅰ-2包括18个县,第Ⅱ类仅包括思茅区,第Ⅲ类仅包括河口县;楚雄州的牟定县与姚安县的遗传一致度最大,为0.943,大姚县与姚安县的遗传一致度也较高,为0.925,思茅区与宁蒗县的遗传一致度最小,为0.033,各县(区)的遗传一致度与地理位置有一定的相关性。本研究结果表明,云南当前种植的地方稻种具有丰富的遗传多样性,但分布很不均匀,遗传多样性主要集中在西双版纳、德宏、普洱、临沧和红河5个州市。