中国野生种葡萄mybA转录因子SNP特征分析

编号 zgly0001460002

文献类型 期刊论文

文献题名 中国野生种葡萄mybA转录因子SNP特征分析

作者 焦健  刘崇怀  樊秀彩  张颖  孙海生  姜建福  李民 

作者单位 中国农业科学院郑州果树研究所 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2013年05期

年份 2013 

分类号 S663.1 

关键词 中国野生葡萄  mybA  花色苷  SNP  遗传多样性 

文摘内容 以中国野生葡萄14个种为材料,对控制花色苷合成的mybA转录因子进行克隆和序列分析,获得VvmybA1和VlmybA2两个转录因子的全长基因序列,共检测到121个SNP,表现出丰富的遗传多样性。3种中性检测方法比较序列变异模式,结果表明,中国野生种葡萄VvmybA1和VlmybA2基因没有偏离中性模型,反映出基因漂移和选择性中性突变之间的平衡。不同野生种材料的mybA基因结构存在很高的同源相似性。但是在启动子区、内含子区以及第3个外显子区存在不同程度碱基的缺失、插入和替换,而且野生种葡萄mybA基因存在一些特有序列或突变,这些突变可以作为分子标记区分不同的野生种材料。通过基因结构比对和系统进化树分析,可将野生种葡萄细分为5个类群。初步推测桦叶葡萄和变叶葡萄进化地位较为原始。