牡丹Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

编号 zgly0001445458

文献类型 期刊论文

文献题名 牡丹Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶序列的克隆及分析

作者 侯小改  郭大龙  黄燕梅  张曦 

作者单位 河南科技大学农学院  河南科技大学林学院 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2013年01期

年份 2013 

分类号 S685.11 

关键词 牡丹  Ty3-gypsy 类反转录转座子  反转录酶  异质性 

文摘内容 根据 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并引物,从中原牡丹(Paeonia suffruticosa Andrews)品种‘洛阳红’和野生种卵叶牡丹(Paeonia qiui Y. L. Pei et D. Y. Hong)中扩增出430 bp 左右的目标片段。目的条带经回收、克隆、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了13 条来自牡丹的 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶序列。这些核苷酸序列具有较高的异质性,主要表现为缺失突变,序列长度变化范围为 412 ～ 446 bp,同源性范围为 71.5% ～ 94.8%。翻译成氨基酸后,有 12 条序列出现 1 ～ 9 个不同程度的终止密码子突变,3 条序列出现移框突变。其核苷酸序列经过系统聚类后可分为 6 个家族。将其氨基酸序列与已登录的不同物种 Ty3-gypsy 反转录转座子反转录酶的氨基酸序列进行聚类分析,结果表明与其他植物具有较高的同源性,表明它们间可能存在着 Ty3-gypsy 反转录转座子的横向传递。