牡丹LINE类反转录转座子RT序列的克隆及分析

编号 zgly0000899388

文献类型 期刊论文

文献题名 牡丹LINE类反转录转座子RT序列的克隆及分析

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 宋程威  郭大龙  张曦  郭丽丽  侯小改 

作者单位 河南科技大学农学院  河南科技大学林学院  河南省高校牡丹工程技术中心 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2014(1)

页码 157-164

年份 2014 

关键词 牡丹  非LTR类反转录转座子  反转录酶 

文摘内容 利用LINE简并引物从中原牡丹品种‘洛阳红’中扩增出580 bp左右的目的条带,对其回收、克隆、测序及相关生物信息学软件分析后获得32条LINE类牡丹反转录转座子RT(反转录酶)序列。这些序列长度为547~593 bp,主要表现为点突变,经Clustal W比对其同源性为25.7%~94.2%。将其核苷酸序列经聚类后可分为4个家族,其中家族Ⅰ和Ⅲ分别占总序列数的50%和28%。将32条RT序列翻译成氨基酸序列,在第18氨基酸序列处有1个非常保守的的甘氨酸(Gly),在138氨基酸序列处有1个半保守的赖氨酸(Lys)位点。32条序列均发生较多的终止密码子突变和移码突变。