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双峰驼NGB基因克隆及序列分析



编号 zgly0001715363

文献类型 期刊论文

文献题名 双峰驼NGB基因克隆及序列分析

作者 杜晓华  米晓钰  胡桂玲  王海芳  刘霞 

作者单位 甘肃农业大学动物医学院  甘肃农业大学生命科学技术学院 

母体文献 中国草食动物科学 

年卷期 2020年04期

年份 2020 

分类号 S824 

关键词 双峰驼  NGB  克隆  序列分析 

文摘内容 对双峰驼NGB基因进行克隆和序列分析,同时探讨双峰驼NGB的生理功能。在血样中提取双峰驼全基因组,采用分段TA克隆法获得NGB基因,运用多种软件对其基因序列及编码产物的结构、功能进行生物信息学分析。结果表明:双峰驼NGB基因序列全长5 210 bp,存在4个外显子(长度为89 bp、112 bp、120 bp、135 bp)、3个内含子(长度为1 505 bp、618 bp、1 437 bp)以及1个长度为257 bp的CpG岛。对双峰驼NGB肽链分析结果显示,包含所有基本氨基酸,各氨基酸数目相差较大,其中亮氨酸(L)占整个氨基酸组成的13.91%,天冬酰胺(N)占1.32%。双峰驼NGB相对分子质量为17 076.62,pI值5.39,半衰期30 h,不稳定系数56.50;蛋白整体呈现亲水性(-0.108),是可溶性蛋白。双峰驼NGB蛋白二级结构预测结果显示,α-螺旋所占比例76.16%,β-折叠所占比例0%,属于全α类蛋白质。双峰驼NGB在细胞骨架中占33.3%,在细胞质中占33.3%,在细胞核中占22.2%,在过氧化物酶体中占11.1%。双峰驼NGB与人亲缘关系最近(98.01%),与其他哺乳动物亲缘关系也较高(97.35%~94.03%),与斑马鱼亲缘关系较低(55.62%),说明NGB在哺乳动物长期进化过程中趋于保守。双峰驼NGB基因的成功克隆及序列分析,为进一步探究双峰驼应对极端环境过程中NGB基因可能发挥的生理功能提供理论基础。

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