基于RNA-Seq数据筛选的小桐子抗冷相关基因的表达模式及其聚类分析

编号 zgly0000859415

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-Seq数据筛选的小桐子抗冷相关基因的表达模式及其聚类分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 王海波  邹竹荣  龚明 

作者单位 云南师范大学生命科学学院  生物能源持续开发利用教育部工程研究中心  云南省生物质能与环境生物技术重点实验室  曲靖师范学院生物资源与环境科学学院  云南师范大学生命科学学院  生物能源持续开发利用教育部工程研究中心云  南省生物质能与环境生物技术重点实验室 

母体文献 基因组学与应用生物学 

年卷期 2014(6)

页码 1196-1205

年份 2014 

关键词 小桐子  RNA-Seq  抗冷相关基因  表达模式  聚类分析 

文摘内容 能源树种小桐子属冷敏植物,受低温胁迫影响涉及到形态、生理、生化、基因表达及调控等多个方面。我们最近通过RNA-Seq技术获得了小桐子低温锻炼转录组(45 251条Unigene)及其数字基因表达谱数据,发现在12℃低温锻炼下有4 185个基因表达量发生变化,其中在不同锻炼时间(12 h,24 h,48 h)内都发生变化的基因有553个。