大肠杆菌Top10甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001347826

文献类型 期刊论文

文献题名 大肠杆菌Top10甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因克隆及生物信息学分析

作者 麻鹏达  张晓英  李海云  马瑞 

作者单位 吉林省农业科学院生物技术中心 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2008年05期

年份 2008 

分类号 Q943.2 

关键词 大肠杆菌Top10  甘露醇-1-磷酸脱氢酶基因  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 根据细菌中存在的甘露醇-1-磷酸脱氢酶(mannitol-1-phosphate dehydrogenase,mtlD)的基因序列,采用PCR扩增的方法从大肠杆菌(Escherichia coli)Top10中克隆到了mtlD基因(Acession numeber:EU433565)。mtlD开放阅读框为1149bp,编码含有382个氨基酸残基,分子量为41.2kD的蛋白,预测等电点为5.37。mtlD含有38个碱性氨基酸,50个酸性氨基酸,158个疏水氨基酸及72个极性氨基酸。二级结构预测表明该蛋白含约60.47%的α-螺旋、4.71%的β-转角、10.73%的延伸链和20.48%的不规则卷曲。亲疏水性分析显示,mtlD是亲水性蛋白。亚细胞定位分析表明mtlD主要定位于细胞质中。序列分析表明大肠杆菌Top10mtlD基因与大肠杆菌W3350、大肠杆菌DEC12a和盐生盐杆菌(Halobacterium salinarum)的mtlD基因同源性分别为99%、97%和93%。大肠杆菌Top10mtlD基因的克隆及生物信息学分析为今后对mtlD的进一步深入研究奠定了基础。