香蕉MADS-Box基因家族的生物信息学分析

编号 zgly0001461662

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉MADS-Box基因家族的生物信息学分析

作者 张远森  秦晓萌  严金平  张昆林  杨恩 

作者单位 昆明理工大学生命科学与技术学院 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2013年10期

年份 2013 

分类号 S668.1 

关键词 香蕉  MADS-box基因家族  生物信息学 

文摘内容 MADS-box基因家族是具有多种生物功能的转录因子,广泛参与植物的生长发育过程以及逆境应答。为了探索MADS-box基因家族在香蕉果实发育到后熟衰老过程中的功能,本文对71个香蕉MADS-box基因家族基因结构、蛋白的基本理化性质、二级结构预测、亚细胞定位、保守基序等方面进行初步生物信息学分析,结果显示:13个香蕉MADS-box基因没有内含子,5个有较长的上游序列;71个香蕉MADS-box蛋白中有52个偏碱性或者强碱性,8个显中性,11个偏酸性;除5个以无规则卷曲为主要构成元件外,香蕉MADS-box蛋白主要以α-螺旋为主要构成元件;大多数MADS-box蛋白定位于细胞核和线粒体基质,少许分布在其他细胞器;基序1(MADS domain)是该家族的保守基序;此外,进化分析发现,香蕉MADS-box基因家族基因主要是II型,I型仅有6个。另外,现有香蕉MADS-box基因家族中,只有37个可查EST序列。