银杏MADS-box基因家族的表达及系统发育分析

编号 zgly0001640026

文献类型 期刊论文

文献题名 银杏MADS-box基因家族的表达及系统发育分析

作者 董金金  刘伟  李萌  王俊燚  何崇单  蔡雨蒙  王启业  王义强 

作者单位 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室  中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室 

母体文献 植物生理学报 

年卷期 2018年06期

年份 2018 

分类号 Q943.2  S792.95 

关键词 银杏  MADS-box基因家族  开花调控  花器官发育 

文摘内容 MADS-box基因是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物花器官发育中发挥重要的调控作用。为了探究MADS-box家族基因在银杏花发育中的功能,本文对银杏花芽分化4个时期的样品进行转录组测序,筛选其中的MADS-box家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位和系统进化分析。结果显示:共得到15个银杏MADS-box家族基因。表达分析表明,目标基因根据表达模式可以分为3种类型。分析目标基因的编码序列显示,15个银杏MADS-box蛋白的主要构件均为α-螺旋和无规则卷曲;亚细胞定位预测主要在细胞核内;所有表达产物均包含MADS结构域。聚类分析显示,银杏MADSbox基因家族可分为6个亚类。银杏MADS-box基因家族中的new Gb2734、Gb38883、Gb28587和Gb33168可能在银杏开花调控中发挥重要作用;Gb16301可能是银杏花器官的发育过程中的关键基因。